A administração do Instituto de Desportos Crato Esporte Clube é exercida pela Diretoria Executiva, sob fiscalização do Conselho Fiscal e orientação do Conselho Deliberativo, na forma do Estatuto Social.
Diretoria Executiva
| Presidente | Aníbal Costa Dantas Júnior |
| Diretor Financeiro | Ruan Rodrigues Lira |
| Diretor Administrativo | Willemar Pereira Xavier Lima |
| Diretora de Captação de Recursos | Tayná Coelho Vieira |
| Diretora Técnico-Pedagógica | Nayane Cruz Figueiredo |
Conselho Deliberativo
| Presidente | José Roberto Silvério de Sousa Júnior |
| Conselheiro Financeiro | Robério Marcolino Pereira |
| Conselheiro de Projetos | Antônio Manoel Alves |
Conselho Fiscal
| Presidente | Thiago Uchoa Sampaio Pinto |
| Conselheira | Bruna Sousa Castro |
| Conselheiro | Giovanni Ximenes Sobreira |
Assembleia Geral
A Assembleia Geral é o órgão soberano do Instituto. Dela participam, com direito a voto, os associados das categorias Fundador, Contribuinte e Benemérito, quites com suas obrigações sociais e admitidos há mais de seis meses. As convocações são publicadas na sede e neste site, e a relação nominal dos associados aptos a votar é divulgada com antecedência mínima de 15 dias.
Os atos de gestão observam os princípios de legalidade, impessoalidade, moralidade, publicidade, eficiência, economicidade, transparência, gestão democrática e profissional, responsabilidade social, inclusão e integridade.
